ALFONSO EDUARDO MARQUEZ CHAMORRO

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Lenguajes y Sistema Informáticos

Investigación

Grupo de investigación

INGENIERÍA DEL SOFTWARE APLICADA (ISA)

Proyectos y contratos de investigación

Optimización de Servicios Basados en Conocimiento Usando Aplicaciones Basadas en Servicios (RTI2018-101204-B-C22 - Investigador/a)
PROSAS: Investigación y Desarrollo en el área de procesos de los ServiciosHorizontales de Tecnologías de la Información y las Comunicaciones del Servi (P015-15/E15 - Investigador/a)
Tecnologias para Servicios Cloud Híbridos, Altamente Configurables y Regulados por Ans (TIN2015-70560-R - Investigador/a)
Copas: Ecosystems for Optimized Process As a Service (P12-TIC-1867 - Investigador/a)
Analisis inteligente de información biomédica (TIN2011-28956-C02-01 - Investigador/a)
Tecnologias para Servicios Cloud Híbridos, Altamente Configurables y Regulados por ANS (TIN2015-70560-R - Participante)
Markexplorer (P094-16/E15 - Investigador/a)
RISE_BPM: Propelling Business Process Management by Research and Innovation Staff Exchange (H2020-645751 - Investigador/a)
Sistemas Inteligentes para descubrir patrones de comportamiento. Aplicación a bases de datos biológicas. Contrato investigador postdoctoral. (TIC 02611 - Investigador/a)
TIC - 200. Sistemas Inteligentes y Minería de datos (tic - 200 - Investigador/a)
Modelos avanzados en minería de datos: aplicación biomédica y medioambiental. Análisis inteligente de información biomédica (TIN2011- 28956-C02-01 - Investigador/a)
BIO-PASS: uso de modalidades transparentes en esquemas de reconocimiento multibiométrico para entornos de aplicacion realistas de baja vulnerabilidad (CICYT TEC2006-13141-C03-01. - Investigador/a)
Sistemas Inteligentes para descubrir patrones de comportamiento. Aplicación a bases de datos biológicas. Contrato investigador predoctoral. (TIC-02611 - Investigador/a)
COPAS: eCosystems for Optimized Process As a Service (P12-TIC-1867 - Investigador/a)

Libros publicados

Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo:
Protein Structure Prediction based on Evolutionary Methods. LAP LAMBERT Academic Publishing. 2013. 978-3-659-39348-8

Capítulos en Libros

Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Bacardit-Peñarroya, Jaume;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
An Efficient Decision Rule-based System for the Protein Residue-residue Contact Prediction. Pág. 592-597. IEEE. IEEE. 2013.
Santiesteban Toca, Cosme E.;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Asencio-Cortes, Gualberto;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo:
Short-range interactions and decision tree-based protein contact map predictor. 2012.
Asencio-Cortes, Gualberto;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Ruiz-Sanchez, Roberto;Santiesteban-toca, Cosme E.:
Prediction of mitochondrial matrix protein structures based on feature selection and fragment assembly. 2012.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Bacardit-Peñarroya, Jaume;Asencio-Cortes, Gualberto;Santiesteban Toca, Cosme E.:
A NSGA-II Algorithm for the Residue-residue Contact Prediction. 2012.
Santiesteban Toca, Cosme E.;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Asencio-Cortes, Gualberto;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
A Decision Tree-Based Method for Protein Contact Map Prediction. Pág. 153-158. En: 6623. 2011.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Asencio-Cortes, Gualberto:
An Evolutionary Approach for Protein Contact Map Prediction. Pág. 101-110. 2011.
Asencio-Cortes, Gualberto;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo:
Prediction of protein distance maps by assembling fragments according to physicochemical similarities. Pág. 271-277. En: 93. 2011.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Asencio-Cortes, Gualberto:
Residue-residue Contact Prediction based on Evolutionary Computation. Pág. 279-283. En: 93. 2011.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Asencio-Cortes, Gualberto:
A multi-objective genetic algorithm for the Protein Structure Prediction . Pág. 1086-1090. 2011.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
EVOLUTIONARY PROTEIN CONTACT MAPS PREDICTION BASED ON AMINO ACID PROPERTIES. Pág. 303-310. En: 2. 2011.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
Evolutionary computation for the prediction of secondary protein structures. Pág. 1082-1087. 2011.
Asencio-Cortes, Gualberto;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo:
A nearest neighbour-based approach for viral protein structure prediction. Pág. 69-76. En: 6623. 2011.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Asencio-Cortes, Gualberto:
Alpha helix prediction based on evolutionary computation. Pág. 358-367. 2010.

Asistencia a congresos

Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Resinas, Manuel:
A Hybrid Reliability Metric for SLA Predictive Monitoring. Comunicación en congreso. 34th ACM Symposium on Applied Computing. Limassol, Chipre. 2019
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Resinas, Manuel:
Does your accurate process predictive monitoring model give reliable predictions?. Comunicación en congreso. 16th International Conference on Service-Oriented Computing . Hangzhou Zhejiang, Anhui, China. 2018
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Asencio-Cortes, Gualberto;Giráldez-Rojo, Raúl;Troncoso-Lora, Alicia:
PROYECTOS DINÁMICOS PARA EL APRENDIZAJE EN LOS PRIMEROS CURSOS DE LAS ENSEÑANZAS DE PROGRAMACIÓN INFORMÁTICA. Comunicación en congreso. I SEMINARIO IBEROAMERICANO DE INNOVACIÓN DOCENTE DE LA UNIVERSIDAD PABLO DE OLAVIDE. UNIVERSIDAD PABLO DE OLAVIDE. 2014
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
Improving the efficiency of MECoMaP: a protein residue-residue contact predictor. Ponencia en Congreso. Congreso Iberoamericano de Reconocimiento de Patrones. Ciudad de la Habana, Cuba. 2013
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Bacardit-Peñarroya, Jaume:
An Efficient Decision Rule-based System for the Protein Residue-residue Contact Prediction. Ponencia en Congreso. Evolutionary Computation, 2013, CEC'2013, IEEE Congress on. CANCUN - MEXICO. 2013
Asencio-Cortes, Gualberto;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo:
PREDICCIÓN DE MAPAS DE DISTANCIAS DE PROTEÍNAS BASADAS EN VECINOS MÁS CERCANOS. Comunicación en congreso. WORKSHOP ESPAÑOL SOBRE EXTRACCIÓN Y VALIDACIÓN DE CONOCIMIENTO EN BASES DE DATOS BIOMÉDICAS: EVABIO 11 (3) (3.2011.TENERIFE, ESPAÑA). TENERIFE, ESPAÑA. 2011
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Asencio-Cortes, Gualberto:
UN ALGORITMO GENÉTICO PARA LA PREDICCIÓN DE MAPAS DE CONTACTO BASADO EN PROPIEDADES DE AMINOÁCIDOS. Comunicación en congreso. WORKSHOP ESPAÑOL SOBRE EXTRACCIÓN Y VALIDACIÓN DE CONOCIMIENTO EN BASES DE DATOS BIOMÉDICAS: EVABIO 11 (3) (3.2011.TENERIFE, ESPAÑA). TENERIFE, ESPAÑA. 2011
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
ALPHA HELIX PREDICTION BASED ON EVOLUTIONARY COMPUTATION.. Ponencia en Congreso. PATTERN RECOGNITION IN BIOINFORMATICS () (.2010.NIJMEGEN, PAISES BAJOS). NIJMEGEN, PAISES BAJOS. 2010
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
DEFINICIÓN DE UMBRAL MÍNIMO PARA LA PREDICCIÓN DE ESTRUCTURA SECUNDARIA DE PROTEÍNAS. Comunicación en congreso. CONGRESO ESPAÑOL SOBRE TECNOLOGÍAS LÓGICA DIFUSA (15) (15.2010.PUNTA UMBRÍA. HUELVA). PUNTA UMBRÍA. HUELVA. 2010
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
MARCO DE REFERENCIA EN LA CALIDAD DE LA PREDICCIÓN DE MAPAS DE CONTACTO DE PROTEÍNAS. Comunicación en congreso. XIII CONFERENCIA DE LA ASOCIACIÓN ESPAÑOLA PARA LA INTELIGENCIA ARTIFICIAL (13) (13.2009.UNIVERSIDAD DE SEVILLA). UNIVERSIDAD DE SEVILLA. 2009

Artículos publicados

Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Resinas, Manuel;Ruiz-Cortés, Antonio:
Predictive Monitoring of Business Processes: A Survey. IEEE Transactions on Services Computing. 2018. Vol: 11. Núm: 6. Pág. 962-977. 10.1109/TSC.2017.2772256.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Resinas, Manuel;Ruiz-Cortés, Antonio;Toro-Bonilla, Miguel:
Run-time prediction of business process indicators using evolutionary decision rules. Expert Systems With Applications. 2017. (In press).
Nepomuceno-Chamorro, Isabel De Los Angeles;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
Building transcriptional association networks in Cytoscape with RegNetC. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2015. Vol: 12. Núm: 4. Pág. 823-824. 10.1109/TCBB.2014.2385702.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Asencio-Cortes, Gualberto;Santiesteban-toca, Cosme;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
Soft computing methods for the prediction of protein tertiary structures: A survey. Applied Soft Computing. 2015. Vol: 35. Pág. 398-410. 10.1016/j.asoc.2015.06.024.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
Soft Computing Methods for Disulfide Connectivity Prediction. Evolutionary Bioinformatics. 2015. Vol: 2015. Núm: 11. Pág. 223-229. 10.4137/EBO.S25349.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Asencio-Cortes, Gualberto;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
Evolutionary decision rules for predicting protein contact maps. Pattern Analysis and Applications. 2014. Vol: 17. Núm: 4. Pág. 725-737. 10.1007/s10044-012-0297-3.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo:
Evolutionary Methods for Protein Structure Prediction. AI communications. 2014.
Bacardit-Peñarroya, Jaume;Widera, Pawel;Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador;Krasnogor, Natalio:
Contact map prediction using a large-scale ensemble of rule sets and the fusion of multiple predicted structural features . Bioinformatics. 2012. Vol: 28. Núm: 19. Pág. 2441-2448. 10.1093/BIOINFORMATICS/BTS472.
Márquez-Chamorro, Alfonso Eduardo;Divina-, Federico;Aguilar-Ruiz, Jesus Salvador:
PROTEIN SECONDARY STRUCTURES PREDICTION BASED ON EVOLUTIONARY COMPUTATION. Applied Computing Review. 2011. Vol: 11. Núm: 4. Pág. 17-25. 10.1145/2107756.2107758.

Tesis dirigidas o codirigidas

(Doctorando no grabado):
New Evolutionary Approaches to Protein Structure Prediction. Tesis Doctoral. 2013